Сотрудничество НИУ "МЭИ" с университетами и организациями Украины активно развивалось в 2005 году, когда были приняты на обучение первые студенты. НИУ "МЭИ" подготовил большое количество высококвалифицированных кадров для ряда стран мира, в числе которых выпускники из Украины.

​​МЭИ сотрудничает со следующими университетами и школами: Национальный технический университет Украины "Киевский политехнический институт", Национальный технический университет "Харьковский политехнический институт", Запорожский национальный технический университет, Национальный педагогический университет имени М. П. Драгоманова, Национальный университет "Львовская политехника", Национальный горный университет.